За возбуждение отвечают супрахиазмальные ядра. Они работают как суточные часы организма. То есть, некий таймер, который говорит организму о том, в какой фазе суток он находится. Основа — биохимическая. То есть, время определяется скоростью биохимических процессов/реакций, проходящих в организме. Таймер включается в момент просыпания после длительного ночного сна (сна, в котором присутствует REM-фаза, или другими словами сна, который длиться 1,5 часа или более). При этом может быть светло, не совсем светло или совсем темно. Поэтому лучше вставать в 9 утра в декабре, когда только-только начинает светать в пасмурную погоду, чем в 6 утра в июне, когда уже во всю светит солнце.